Trải qua 60 năm xây dựng và phát triển, Viện Khoa học Thủy lợi Việt Nam luôn đồng hành cùng sự phát triển của đất nước. Từ những năm 60 của thế kỷ trước, các nghiên cứu của Viện đã giúp cho hàng vạn ha ruộng được đảm bảo tưới tiêu, giúp thâm canh tăng năng suất, sản xuất lúa hai 2 vụ, 3 vụ... Ngày nay, trước những thách thức về biến đổi khí hậu, khai thác thượng nguồn và phát triển kinh tế nội tại, các nghiên cứu của Viện được thực hiện theo hướng các cụm, nhóm nhiệm vụ để giải quyết toàn diện, đồng bộ những vấn đề lớn của thực tiễn như sạt lở, hạn hán, xâm nhập mặn, an toàn hồ đập… Nhờ đó, các sản phẩm khoa học và công nghệ (KH&CN) của Viện luôn đáp ứng tốt các yêu cầu của thực tiễn, phục vụ hiệu quả cho công tác quản lý, điều hành của các cơ quan quản lý. Những nỗ lực của Viện trong 60 năm qua đã được ghi nhận bằng Huân chương Độc lập hạng Nhất, Nhì, Ba; Huân chương Lao động hạng Nhất, Nhì, Ba; danh hiệu Anh hùng lao động trong thời kỳ đổi mới năm 1999, đặc biệt là Huân chương Hồ Chí Minh năm 2019.