Trong những năm qua, hoạt động của Quỹ Phát triển Khoa học và Công nghệ Quốc gia (Nafosted) đã tạo được những chuyển biến tích cực trong phương thức tổ chức, quản lý hoạt động nghiên cứu khoa học, được cộng đồng ghi nhận, đánh giá cao. Tuy nhiên bên cạnh những kết quả đạt được, trong hoạt động của Nafosted cũng còn những hạn chế, thách thức, cần tiếp tục được hoàn thiện để thực sự trở thành địa chỉ tin cậy của các nhà khoa học, sử dụng hiệu quả nguồn lực tài chính, đầu tư có hiệu quả cho phát triển khoa học và công nghệ (KH&CN).