Thứ hai, 25/03/2019 00:11
Xác định vị trí phân loại mẫu Alocasia sp. thu thập ở Xuân Sơn (Phú Thọ) trên cơ sở phân tích 3 vùng gen matK, petD và trnY-trnE
Bùi Hồng Quang1 , Nguyễn Văn Dư1*, Lê Thị Mai Linh1 , Lê Xuân Đắc2 , Hà Minh Tâm3
* Tác giả liên hệ: email: vandu178@gmail.com
1 Viện Sinh thái và Tài nguyên sinh vật, Viện Hàn lâm KH&CN Việt Nam
2 Trung tâm Nhiệt đới Việt - Nga
3 Khoa Sinh học, Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2
Ngày nhận bài: 18/01/2019; ngày chuyển phản biện: 25/01/2019; ngày nhận phản biện: 28/02/2019; ngày chấp nhận đăng: 04/03/2019
Tóm tắt:
Bài báo phân tích sự khác biệt giữa mẫu Alocasia sp. 87 mới thu được ở Phú Thọ với các loài trong chi Alocasia và các chi liên quan dựa trên phân tích trình tự nucleotide vùng gen matK, petD, trnY-trnE. Kết quả nghiên cứu cho thấy, trình tự các axit nucleotide của mẫu nghiên cứu tương đồng với chi Alocasia 98%, chi Cocolasia 93%. Kết quả phân tích vùng gen matK ghi nhận, mẫu Alocasia sp. 87 tách biệt ra khỏi nhóm của các loài đã biết thuộc chi Alocasia. Đối với vùng gen petD ghi nhận mẫu Alocasia sp. 87 thuộc cùng nhóm với chi Alocasia và Leucocasia, tuy nhiên mẫu này đã có sự tách biệt tạo thành một nhánh riêng. Nhóm tác giả nghi ngờ mẫu Alocasia sp. 87 có thể thuộc về một loài mới.
Từ khóa:
Alocasia sp., matK, petD, Phú Thọ, TrnY-TrnE, Việt Nam
Determination of taxonomic location of the Alocasia sp. sample collected in Xuan Son (Phu Tho province) based on analysis results of genes matK, petD and trnY-trnE
Hong Quang Bui1 , Van Du Nguyen1*, Thi Mai Linh Le1 , Xuan Dac Le2 , Minh Tam Ha3
1 Institute of Ecology and Biological Resources, VAST
2 Vietnam - Russia Tropical Center
3 Hanoi Pedagogical University 2
Received: 18 January 2019; accepted: 4 March 2019
Abstract:
The paper analysed the difference between the sample of Alocasia sp. 87 recently collected from Phu Tho province of Vietnam and the samples of Alocasia species and related genera based on nucleotide sequence analysis of matK, petD, and trnY-trnE gene regions. The results showed that the studied sample was similar 98% to Alocasia genus, and 93% to Cocolasia genus. The results of matK genomic region analysis also recorded that the sample of Alocasia sp. 87 was separated from the known species of Alocasia genus. For the petD gene region, the sample of Alocasia sp. 87 was similar to the group of the genera Alocasia and Leucocasia; however, it seems to separate into a different branch. The authors suspect that Alocasia sp. 87 could be a new species.
Keywords:
Alocasia sp., matK, petD, Phu Tho, trnY-trnE, Vietnam.
Classification number:
1.6