Thứ tư, 25/07/2018 00:58
Số 7 năm 201853 - 59Download

Phân tích đa dạng di truyền hệ gen ty thể và nguồn gốc tiến hóa của sáu giống lợn bản địa Việt Nam

Bùi Anh Tuấn1, Nguyễn Đức Hiếu2, Nghiêm Ngọc Minh2, Võ Thị Bích Thủy2*

*Tác giả liên hệ: thuybvo@ibt.ac.vn

 

1Viện Khoa học hình sự, Bộ Công an

2Viện Nghiên cứu hệ gen, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam

Ngày nhận bài: 26/03/2018; ngày chuyển phản biện: 30/03/2018; ngày nhận phản biện: 02/05/2018; ngày chấp nhận đăng: 07/05/2018

Tóm tắt:

Cây phát sinh chủng loại của 33 giống lợn nhà và lợn hoang thuộc nhánh châu Âu và châu Á, trong đó có 6 giống lợn bản địa Việt Nam đã được dựng lên từ dữ liệu trình tự vùng D-loop và vùng mã hóa của hệ gen ty thể. Lần đầu tiên dữ liệu hoàn chỉnh về hệ gen ty thể của 6 giống lợn Ỉ, Móng Cái, Mường Khương, Mường Lay, Hương và Hạ Lang được công bố trên GenBank với các mã số truy cập KX094894, KU556691, KY432578, KX147101, KY964306 và KY800118. Mục tiêu của nghiên cứu này là xác định trình tự hoàn chỉnh hệ gen ty thể của cả 6 giống lợn, chú giải chức năng hệ gen, phân tích đa hình trình tự mtDNA, qua đó làm cơ sở để nghiên cứu phát sinh chủng loại, xác định về nguồn gốc và quan hệ tiến hóa của các giống lợn này với các giống lợn khác trên thế giới, phục vụ trực tiếp cho mục tiêu bảo tồn nguồn gen. Kết quả dựa trên khảo sát về khoảng cách di truyền và mối quan hệ phát sinh phân tử cho biết mối quan hệ di truyền theo dòng mẹ giữa 6 giống lợn bản địa Việt Nam và những giống lợn bản địa này có mối quan hệ gần gũi với các nhóm lợn Nam Trung Quốc và lưu vực sông Hoàng Hà. Những kết quả nghiên cứu của đề tài là nguồn dẫn liệu quan trọng cho các nghiên cứu khác về các giống lợn bản địa ở Việt Nam.

Từ khóa:

Hệ gen ty thể, phát sinh chủng loại, Sus scrofa, tiến hóa phân tử.

Chỉ số phân loại:
4.6

Genetic diversity of mitochondrial genome and evolutional origin of six Vietnamese indigenous pig breeds

Anh Tuan Bui1, Duc Hieu Nguyen2, Ngoc Minh Nghiem2, Thi Bich Thuy Vo2*

1Institute of Forensic Science, Ministry of Public Security

2Institute of Genome Research, Vietnam Academy of Science and Technology

Received: 26 March 2018; accepted: 7 May 2018

Abstract:

The phylogenetic trees of 33 domestic and wild boar pig breeds of Asian and European clades, including six Vietnamese indigenous pig breeds were reconstructed from D-loop region and coding region sequence using the Bayesian inference method. It is the first time the complete mitochondrial genome of the I, Mong Cai, Muong Khuong, Muong Lay, Huong, and Ha Lang pig breeds was sequenced and deposited on GenBank (ac-cession numbers: KX094894, KU556691, KY432578, KX147101, KY964306, and KY800118, respectively). The genetic distances and phylogenetic relationships, based on both the mtDNA and the D-loop region, re-vealed that all of six Vietnamese pig breeds belonged to Asian clade with the close evolutionary relationship to other pig breeds from South China and Chinese Yellow River Valley. The publication of the mitochondrial ge-nome sequences will make an important contribution to elucidating the relationship among Vietnamese indige-nous pig breeds and supporting the selection of suitable ones for pig breeding in the area.

Keywords:

Mitochondrial genome, molecular evolution, phylogenetic relationship, Sus scrofa.

Classification number:
4.6
Lượt dowload: 476 Lượt xem: 1807

Đánh giá

X
(Di chuột vào ngôi sao để chọn điểm)
Chấm điểm