Thứ bảy, 25/02/2017 00:39
Số 2 năm 201739 - 44Download

Đánh giá đa dạng di truyền các loài quế Thanh Hóa bằng chỉ thị RAPD

Khuất Hữu Trung1, Kiều Thị Dung1, Lưu Cảnh Trung2, Nguyễn Huy Hoàng2, Hồ Trung Lương2

*Tác giả liên hệ: Email: khuathuutrung@yahoo.com

 

1Viện Di truyền nông nghiệp

2 Viện Nghiên cứu lâm sinh

 

 

Ngày nhận bài: 18/12/2015; ngày chuyển phản biện: 05/01/2016; ngày nhận phản biện: 07/03/2016; ngày chấp nhận đăng: 29/04/2016

Tóm tắt:

Nghiên cứu phân loại các loài quế ở Việt Nam chủ yếu dựa vào các đặc điểm hình thái và chịu ảnh hưởng nhiều bởi yếu tố môi trường. Chỉ thị phân tử RAPD là một phương pháp đáng tin cậy để xác định các loài quế một cách chính xác. Trong nghiên cứu này, phân tích RAPD-PCR gồm 22 mồi ngẫu nhiên đã được sử dụng để đánh giá đa dạng di truyền 32 mẫu giống quế Thanh Hoá. Kết quả phân tích PCR nhân lên được 3.137 băng bao gồm 126 loại băng với kích cỡ khác nhau. Trong đó có 61 băng cho đa hình (chiếm 48,41%) và 65 băng đơn hình (chiếm 51,59%). Số băng nhân lên ở mỗi mồi dao động từ 3 đến 11 loại băng, trung bình 5,8 băng/mồi. Hệ số tương đồng di truyền của 32 mẫu giống quế dao động từ 0,67 đến 0,97. Dựa vào hệ số tương đồng di truyền, có thể chia 32 mẫu giống nghiên cứu thành 6 nhóm lớn. Kết quả nghiên cứu cũng đã xác định được 2 băng cá biệt xuất hiện ở 2 mồi có thể sử dụng làm marker nhận dạng chính xác 2 nguồn gen khác nhau. Mồi OPN20 và UBC728 có thể nhận biết được mẫu giống tương ứng là TT02 và XC24.

Từ khóa:

chỉ thị RAPD, Cinnamomum, đa dạng di truyền, quế.

Chỉ số phân loại:
4.6

Genetic diversity of Cinnamomum samples in Thanh Hoa based on RAPD markers

Received: 18 December 2015; accepted: 29 April 2016

Abstract:

The classification of Cinnamomum species is still based on morphological characters which are influenced by environmental factors. Therefore, molecular markers such as randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) were employed in order to find a more reliable approach for identifying Cinnamomum samples correctly. RAPD-PCR analysis involving the 22 random primers was used to assess the genetic diversity of 32 Cinnamomum sp. samples that have been originated from Thanh Hoa province. The results showed that a total of 3137 bands were detected, with 126 type bands at different sizes. Out of which, 61 polymorphic bands (48.41%) and 65 monomorphic bands (51.59%) were amplified. The number of polymorphic bands detected by each RAPD marker ranged from 3 to 11, with a mean of 5.8 bands per locus. Genetic similarity coefficients of 32 Cinnamomum samples ranged from 0.67 to 0.97. Based on genetic similarity coefficient, 32 Cinnamomum samples were divided into six major groups. Identification of 2 unique bands observed in 2 primers that can be used to identify exactly 2 different genetic resources. The OPN20 and UBC728 primers can be used to identify TT02 and XC24 varietiy, respectively. The obtained results are useful for classification and exact identification of some genetic resources that will be provided for the conservation and breeding.

 

Keywords:

Cinnamomum sp., genetic diversity, RAPD marker.

Classification number:
4.6
Lượt dowload: 327 Lượt xem: 753

Đánh giá

X
(Di chuột vào ngôi sao để chọn điểm)