Thứ bảy, 25/11/2017 00:14
Xác định tần suất kiểu gen đồng hợp và dị hợp của kiểu hình xoáy lưng trên chó xoáy Phú Quốc (Canis familiaris) tại Việt Nam bằng kỹ thuật real-time PCR
Quan Quốc Đăng1*, Trần Hoàng Dũng2 , Chung Anh Dũng3 , Phạm Công Hoạt4
* Tác giả liên hệ: dangquan3580@gmail.com
1 Trung tâm Phát triển Khoa học và Công nghệ trẻ, Thành đoàn TP Hồ Chí Minh
2 Trường Đại học Nguyễn Tất Thành
3 Viện Khoa học Kỹ thuật Nông nghiệp Miền Nam
4 Bộ Khoa học và Công nghệ
Ngày nhận bài: 15/09/2017; ngày chuyển phản biện: 18/09/2017; ngày nhận phản biện: 20/10/2017; ngày chấp nhận đăng: 27/10/2017
Tóm tắt:
Chó Phú Quốc là một loại chó riêng của đảo Phú Quốc. Đặc điểm phân biệt với các loại chó khác là các xoáy lông ở trên sống lưng, là một trong ba dòng chó có xoáy lông trên lưng trên thế giới. Tính trạng xoáy lưng là tính trạng trội (ký hiệu R) liên quan đến triệu chứng viêm xoang thần kinh, gây thoái hóa giống và tử vong trong bầy đàn. Trong nghiên cứu này, kỹ thuật real-time PCR với 4 cặp mồi được sử dụng nhằm đánh giá sự thay đổi số bản copy (copy number variation - CNV) của vùng DNA 133 kb trên nhiễm sắc thể (NST) số 18 quy định tính trạng trội xoáy lưng với mục đích xác định tần suất của kiểu gen đồng hợp và dị hợp của gen R trên chó Phú Quốc. Kết quả thu được có thể sử dụng nhằm kiểm tra kiểu gen của tính trạng xoáy lưng trong quá trình bảo tồn, hạn chế sự phát triển của bệnh viêm xoang thần kinh, tạo cân bằng quần thể và phát triển dòng chó đặc trưng này của Việt Nam.
Từ khóa:
Chó xoáy lưng Phú Quốc, dị hợp, đồng hợp, real-time PCR, sao chép số biến thể, viêm xoang thần kinh.
The method to identify the genetic frequency of ridgeback mutation on Phu Quoc ridgeback dog (Canis familiaris) in Vietnam
Quoc Dang Quan1*, Hoang Dung Tran2 , Anh Dung Chung3 , Cong Hoat Pham4
1 Center of Science and Technology Development, Ho Chi Minh city
2 Nguyen Tat Thanh University
3 Institute of Agricultural Science for Southern Vietnam
4 Ministry of Science and Technology
Received: 15 September 2017; accepted: 27 October 2017
Abstract:
Phu Quoc dog is one of typical species of Phu Quoc Island, Vietnam. The distinguishing feature of this dog is the ridgeback on the spine. The ridge mutation is an autosomal dominant trait associated with dermoid sinus symptom which causes degeneration and puppies death. The dominant allele causing the ridge is denoted as R whereas the recessive wild type-allele is denoted as r. This means that a ridged dog may either be homozygous (R/R) or heterozygous (R/r) for the Ridge allele whereas all ridgeless dogs should be homozygous r/r for the normal allele. In this study, real-time PCR with 4 primer pairs was used to evaluate the copy number variation (CNV) of the 133 kb region on chromosome 18 to identify the genetic frequency for this dominant mutiation. The results could be used to test the genotype of dominant mutiation for conservation programs, restrict the development of dermoid sinus symptom, an make balance in population growth of this endemic species.
Keywords:
Copy number variation, dermoid sinus, heterozygous, homozygous, Phu Quoc Ridgeback dog, real-time PCR
Classification number:
1.6