Thứ bảy, 25/02/2017 00:56
Số 2 năm 201749 - 52Download

Sử dụng chỉ thị mã vạch để phân loại ốc hương

Thái Thanh Bình1* Nguyễn Văn Hà2, Lưu Văn Huyền3

‘Tác giả liên hệ: Email: ttbinh@cdts.edu.vn

 

 

1Trường Cao đẳng thủy sản

2 Viện Nghiên cứu nuôi trồng thủy sản III

3Trường Đại học Tài nguyên và môi trường

 

 

Ngày nhận bài: 08/09/2016; ngày chuyển phản biện: 12/09/2016; ngày nhận phản biện: 14/10/2016; ngày chấp nhận đăng: 21/10/2016

Tóm tắt:

Ốc hương là loài nhuyễn thể có giá trị kinh tế cao. Hiện nay, ốc hương được nuôi phổ biến trong ao và lồng tại các tỉnh như: Phú Yên, Khánh Hòa, Bình Thuận, Kiên Giang. Sản lượng ốc hương cả nước hàng năm đạt trên 7.000 tấn. Nghề nuôi ốc hương phát triển được hơn 15 năm nhưng phân loại ốc hương còn chưa rõ ràng. Nghiên cứu trình bày kết quả phân loại ốc hương được thu từ 7 tỉnh ở Việt Nam bằng mã vạch ADN vùng gen COI (Cytochrome c oxidase subunit I). Trình tự ADN của ốc hương Việt Nam được so sánh với trình tự ADN dữ liệu các loài ốc hương trên ngân hàng gen. Kết quả nghiên cứu cho thấy, số lượng Haplotype phát hiện được là 6, hệ số đa dạng haplotype là 0,442±0,124, hệ số đa dạng nucleotide là 0,0008, ốc hương Việt Nam giống với mẫu ốc hương Babylonia areolata ở ngân hàng gen. Kết quả phân tích di truyền phả hệ cũng xác định ốc hương Việt Nam là loài Babylonia areolata.

Từ khóa:

 ADNmã vạch, Babylonia areolata, COI, ốc hương.

Chỉ số phân loại:
4.6

Application of DNA barcoding markers to classify Spotted babylon

Received: 8 September 2016; accepted: 21 October 2016

Abstract:

Spotted babylon is a high value molluscous species. Nowadays spotted babylons are cultivating popularly in ponds and cages in Phu Yen, Khanh Hoa, Binh Thuan, and Kien Giang provinces. The annual production of spotted babylons is about 7000 tons. Although spotted babylons have been cultured over 15 years, the taxonomy of this species is still unclear. This study presents the taxonomy results of babylon snails collected from seven provinces in Vietnam using DNA barcoding of COI gene region. The DNA sequencing of Vietnamese spotted babylons was compared with those of Genbank data. The results of the study showed that 6 haplotypes was found. The haplotype diversity was 0.442±0.124; the nucleotide diversity was 0.0008; and Vietnamese spotted babylonia was similar to the Babylonia areolata samples from the Genbank. Phylogenetic analysis also identified that Vietnamese spotted babylon is Babylonia areolata.

 

 

Keywords:

 Babylonia areolata, COI, DNA barcoding, Spotted babylon.

Classification number:
4.6
Lượt dowload: 417 Lượt xem: 989

Đánh giá

X
(Di chuột vào ngôi sao để chọn điểm)
Chấm điểm