Thứ năm, 25/07/2019 00:00
Số 7 năm 201960 - 64Download

Đánh giá đa dạng di truyền một số giống bơ (Persea americana Mill.) bằng chỉ thị phân tử SSR

Phạm Thị Phương1*, Phạm Đức Toàn2 , Nguyễn Vũ Phong2*

Tác giả liên hệ: ptphuong@gmail.com; nvphong@hcmuaf.edu.vn

1 Trường Đại học Tây Nguyên

2 Trường Đại học Nông lâm TP Hồ Chí Minh 

Ngày nhận bài: 14/01/2019; ngày chuyển phản biện: 18/01/2019; ngày nhận phản biện: 22/02/2019; ngày chấp nhận đăng: 18/03/2019

Tóm tắt:

Cây bơ (Persea americana Mill.) được du nhập và trồng khá phổ biến ở vùng Tây Nguyên và Đông Nam Bộ. Mục tiêu của nghiên cứu này nhằm đánh giá mức độ đa dạng di truyền của 24 giống bơ dựa trên chỉ thị phân tử SSR. Tổng số 18 primer SSR đã ghi nhận kết quả có 59 băng đa hình trong tổng số 62 băng khuếch đại với kích thước dao động từ 70 đến 350 bp, trung bình 3,44 băng/primer. 3 primer cho kết quả 5 băng đa hình là AVAG13, AVAG21 và LMAV.33. Chỉ số PIC của các primer dao động từ 0,12 đến 0,9, trong đó primer LMAV.06 và primer LMAV.33 có tính đa hình cao nhất. Kết quả phân tích cũng cho thấy hệ số tương đồng di truyền của 24 giống bơ biến thiên từ 0,12 đến 0,99. Kết quả phân nhóm di truyền đã chia các giống bơ thành 6 nhóm chính với khoảng cách di truyền trung bình là 0,39.

Từ khóa:

bơ, đa dạng di truyền, Persea americana Mill., SSR

Chỉ số phân loại:
4.6

Assessment on the genetic diversity of some avocado (Persea americana Mill.) varieties using microsatellite markers

Thi Phuong Pham1*, Duc Toan Pham2 , Vu Phong nguyen2*

1 Tay Nguyen University

2 Nong Lam University Ho Chi Minh City

Received: 14 January 2019; accepted: 18 March 2019

Abstract:

Persea americana Mill is cultivated popularly in the Central Highlands and South Eastern regions of Vietnam. The purpose of this study was to assess the genetic diversity of twenty-four avocado (Persea americana Mill.) varieties based on molecular markers SSR. The PCR analysis with 18 SSR markers showed 62 amplified bands including 59 polymorphic bands, and other properties such as 3.44 bands/primer and molecular sizes ranging from 70 to 350 bp. Three primers namely AVAG13, AVAG21 and LMAV.33 gave five polymorphic bands. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.12 to 0.90, in which LMAV.06 and LMAV.33 markers had the highest polymorphism. The analysis result also exhibited the similarity coefficient of twenty-four avocado varieties varied from 0.12 to 0.99. The phylogenetic analysis divided the genotypes into six main groups which have the mean similarity coefficient of 0.39.

Keywords:

avocado, genetic diversity, Persea americana Mill., SSR.

Classification number:
4.6
Lượt dowload: 502 Lượt xem: 1189

Đánh giá

X
(Di chuột vào ngôi sao để chọn điểm)
Chấm điểm