Viện Ứng dụng Công nghệ, tiền thân là Viện Nghiên cứu Công nghệ Quốc gia được thành lập ngày 16/10/1984 theo Nghị định 135/HĐBT của Hội đồng Bộ trưởng (nay là Chính phủ). Viện đã trải qua ba giai đoạn phát triển: từ 1984 đến 1994 trực thuộc Hội đồng Bộ trưởng; từ 1994 đến 2004 trực thuộc Bộ Khoa học, Công nghệ và Môi trường (được đổi tên thành Viện Nghiên cứu Ứng dụng Công nghệ); từ 2005 đến nay trực thuộc Bộ Khoa học và Công nghệ (giai đoạn phát triển với tinh thần tự chủ). Trong suốt quá trình xây dựng và phát triển, Viện luôn được giao thực hiện chức năng nghiên cứu khoa học, triển khai ứng dụng các công nghệ cao, công nghệ mới trong các lĩnh vực: công nghệ laser, quang điện tử, vi điện tử, công nghệ thông tin - điều khiển tự động, sinh học, vật liệu mới, môi trường. Tiếp bước truyền thống 30 năm, trong giai đoạn 2015-2019, Viện Ứng dụng Công nghệ luôn đẩy mạnh công tác nghiên cứu ứng dụng, chuyển giao công nghệ và đạt được nhiều thành tích rất đáng khích lệ, đóng góp thiết thực cho phát triển kinh tế - xã hội của đất nước