Thứ năm, 21/05/2020 08:20
Số 5 năm 20206 - 12Download

So sánh các kỹ thuật định danh vi khuẩn Burkholderia pseudomallei trong xét nghiệm chẩn đoán bệnh Whitmore

Hoàng Việt Hà1, Bùi Nguyễn Hải Linh2, Trần Thị Lệ Quyên2, Phạm Thị Huyền1, Hoàng Quang Trung1, Trần Anh Đào3, Nguyễn Vũ Trung4 và Trịnh Thành Trung2*

*Tác giả liên hệ: Email: tttrung@vnu.edu.vn

1Bệnh viện Đa khoa tỉnh Hà Tĩnh

2Viện Vi sinh vật và Công nghệ sinh học, Đại học Quốc gia Hà Nội

3Bệnh viện Đa khoa tỉnh Nghệ An

4Trường Đại học Y Hà Nội

Ngày nhận bài: 19/02/2020; ngày chuyển phản biện: 21/02/2020; ngày nhận phản biện: 19/03/2020; ngày chấp nhận đăng: 27/03/2020

Tóm tắt:

Burkholderia pseudomallei (B. pseudomallei) là một loài vi khuẩn sống trong đất, lây truyền và gây nhiễm melioidosis (hay còn gọi là bệnh Whitmore) cho người và nhiều loài động vật. Đặc điểm sinh học của B. pseudomallei là trực khuẩn Gram âm, oxydase dương, kháng tự nhiên với kháng sinh gentamicin (Gen) và colistin (Col) nhưng nhạy cảm với amoxicillin clavulanic acid (AmC). Để áp dụng đặc trưng điển hình này trong định danh các chủng B. pseudomallei phân lập từ các mẫu bệnh phẩm lâm sàng, các tác giả đã tiến hành nghiên cứu 169 chủng trực khuẩn Gram âm, oxydase dương phân lập tại Bệnh viện Đa khoa tỉnh Hà Tĩnh từ tháng 7/2018 đến 12/2018. Kết quả định danh bằng real-time PCR đặc hiệu gene TTSS1, giải trình tự gene recA và 16S rRNA khẳng định 17 chủng là B. pseudomallei. 17 chủng này đều đáp ứng tiêu chí đặc trưng của vi khuẩn B. pseudomallei về nhạy cảm 3 khoanh kháng sinh với đường kính (r) kháng Gen (r=6 mm), kháng Col (r=6 mm) và nhạy AmC (18 mmB. pseudomallei bằng 3 khoanh kháng sinh này là 100%, trong khi đó độ chính xác của phương pháp sinh hóa API 20NE và Vitek 2 lần lượt là 76,4% (13/17) và 29,4% (5/17). 5 chủng vi khuẩn Cupriavidus malaysiensis cũng kháng Gen và Col nhưng đường kính vòng nhạy cảm AmC là khoảng 42-43 mm. Kết quả nghiên cứu này cho thấy, phương pháp định danh B. pseudomallei bằng 3 khoanh kháng sinh có độ chính xác cao và có thể triển khai tại nhiều phòng xét nghiệm vi sinh ở Việt Nam nhằm hạn chế việc định danh sai vi khuẩn B. pseudomallei và bỏ sót xét nghiệm ca nhiễm melioidosis.

Từ khóa:

Burkholderia pseudomallei, melioidosis, Whitmore, 3 khoanh kháng sinh.

Chỉ số phân loại:
3.1

Comparison of different identification methods for Burkholderia pseudomallei in the diagnosis of Whitmore’s disease

Viet Ha Hoang1, Nguyen Hai Linh Bui2, Thi Le Quyen Tran2, Thi Huyen Pham1, Quang Trung Hoang1, Anh Dao Tran3, Vu Trung Nguyen4 and Thanh Trung Trinh2*

*Email: tttrung@vnu.edu.vn

1Ha Tinh General Hospital
2Institute of Microbiology and Biotechnology, Vietnam National University, Hanoi
3Nghe An General Hospital 
4Hanoi Medical University
 

Received: 19 February 2020; accepted: 27 March 2020

Abstract:

Burkholderia pseudomallei is a soil-dwelling bacterium which can infect human and animals causing a fatal infectious disease of melioidosis (or Whitmore’s disease). The biological characteristics of this bacterium are Gram-negative bacilli, oxydase-positive, naturally resistant to gentamicin (Gen) and colistin (Col) but sensitive to amoxicillin-clavulanic acid (AmC). To use these particular characteristics for the identification of B. pseudomallei, the authors investigated 169 oxydase-positive and Gram-negative bacilli strains isolated from clinical specimens at Ha Tinh General Hospital from July to December 2018. TTSS1 real-time PCR assay, recA and 16S rRNA gene sequence analyses confirmed 17 strains as B. pseudomallei. These 17 strains demonstrated the particular characteristics of three-antibiotic disc test with the diameter (r) Gen resistance (r=6 mm), Col resistance (r=6 mm) and AmC sensitivity (18 mm<r<26 mm). The identification accuracy of this method for B. pseudomallei was 100% while the accuracy of the two biochemistry methods API 20NE and Vitek 2 were 76.4% (13/17) and 29.4% (5/17), respectively. Five strains of Cupriavidus malaysiensis were also resistant to Gen and Col but sensitive to AmC with inhibition zone diameter of 42-43 mm. In comparison with the routine identification methods, the identification of B. pseudomallei from oxydase-positive and Gram-negative bacilli using three-antibiotic disc test was a reliable and accurate method and could be implemented in the medical microbiology laboratories in Vietnam to reduce and avoid the misdiagnosis of melioidosis.

Keywords:

Burkholderia pseudomallei, melioidosis, three-antibiotic disc test, Whitmore.

Classification number:
3.1
Lượt dowload: 646 Lượt xem: 2655

Đánh giá

X
(Di chuột vào ngôi sao để chọn điểm)
Chấm điểm